Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTMR11A4FU01 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTMR11A4FU01 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms