Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TCRBV5S1A1TA0A578 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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TCRBV5S1A1TA0A578 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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TCRBV5S1A1TA0A578 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TCRBV5S1A1TA0A578 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TCRBV5S1A1TA0A578 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TCRBV5S1A1TA0A578 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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TCRBV5S1A1TA0A578 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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TCRBV5S1A1TA0A578 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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TCRBV5S1A1TA0A578 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBV5S1A1TA0A578 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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