Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mecp2Q9Z2D6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mecp2Q9Z2D6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mecp2Q9Z2D6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mecp2Q9Z2D6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mecp2Q9Z2D6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mecp2Q9Z2D6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mecp2Q9Z2D6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mecp2Q9Z2D6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mecp2Q9Z2D6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mecp2Q9Z2D6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mecp2Q9Z2D6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mecp2Q9Z2D6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms