Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ARHGEF12Q9NZN5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARHGEF12Q9NZN5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ARHGEF12Q9NZN5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ARHGEF12Q9NZN5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ARHGEF12Q9NZN5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF12Q9NZN5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGEF12Q9NZN5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGEF12Q9NZN5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGEF12Q9NZN5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGEF12Q9NZN5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
ARHGEF12Q9NZN5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ARHGEF12Q9NZN5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ARHGEF12Q9NZN5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ARHGEF12Q9NZN5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGEF12Q9NZN5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ARHGEF12Q9NZN5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 448.2 ms