Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CDK12Q9NYV4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CDK12Q9NYV4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDK12Q9NYV4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CDK12Q9NYV4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CDK12Q9NYV4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK12Q9NYV4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK12Q9NYV4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDK12Q9NYV4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK12Q9NYV4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK12Q9NYV4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK12Q9NYV4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CDK12Q9NYV4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CDK12Q9NYV4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK12Q9NYV4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms