Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARHGEF4Q9NR80 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF4Q9NR80 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF4Q9NR80 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGEF4Q9NR80 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms