Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnmb4Q9JIN6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnmb4Q9JIN6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnmb4Q9JIN6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnmb4Q9JIN6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnmb4Q9JIN6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms