Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr61Q9ERF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr61Q9ERF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr61Q9ERF3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Wdr61Q9ERF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr61Q9ERF3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Wdr61Q9ERF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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