Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3s1Q9DCR2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap3s1Q9DCR2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3s1Q9DCR2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap3s1Q9DCR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms