Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx7Q9CY18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx7Q9CY18 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx7Q9CY18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx7Q9CY18 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx7Q9CY18 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx7Q9CY18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx7Q9CY18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx7Q9CY18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms