Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSMEM1Q8WWF3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSMEM1Q8WWF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSMEM1Q8WWF3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSMEM1Q8WWF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSMEM1Q8WWF3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms