Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.594e-30■■■■■ 81.7
PUM2Q8TB72 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.634e-30■■■■■ 81.7
PUM2Q8TB72 CAMTA2-212ENST00000574951 4431 ntTSL 511.09□□□□□ -0.634e-30■■■■■ 81.7
PUM2Q8TB72 CAMTA2-203ENST00000381311 4374 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.734e-30■■■■■ 81.7
PUM2Q8TB72 GAS6-205ENST00000610073 2169 ntTSL 219.42■□□□□ 0.77e-32■■■■■ 81.5
PUM2Q8TB72 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.547e-32■■■■■ 81.5
PUM2Q8TB72 GAS6-204ENST00000608763 2646 nt17.99■□□□□ 0.477e-32■■■■■ 81.5
PUM2Q8TB72 GAS6-203ENST00000480426 2507 ntTSL 216.38■□□□□ 0.217e-32■■■■■ 81.5
PUM2Q8TB72 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 IRF1-208ENST00000472045 5153 ntTSL 211.79□□□□□ -0.522e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 POC5-213ENST00000514838 1984 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.882e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 IRF1-201ENST00000245414 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 ARFIP1-205ENST00000451320 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.92e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 ARFIP1-207ENST00000510497 571 ntTSL 48.17□□□□□ -1.12e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.972e-12■■■■■ 81.4
PUM2Q8TB72 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 81.3
PUM2Q8TB72 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 81.3
PUM2Q8TB72 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 521.84■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-224ENST00000584557 2000 nt21.06■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-201ENST00000293208 1272 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.123e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-220ENST00000583329 998 ntTSL 312.63□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-214ENST00000580601 2786 ntTSL 212.13□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-207ENST00000578756 652 ntTSL 211.56□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-209ENST00000579005 462 ntTSL 311.56□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 29.82□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 81.1
PUM2Q8TB72 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.931e-323■■■■■ 80.9
PUM2Q8TB72 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.111e-323■■■■■ 80.9
PUM2Q8TB72 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.131e-323■■■■■ 80.9
PUM2Q8TB72 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 80.9
PUM2Q8TB72 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 80.7
PUM2Q8TB72 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.073e-9■■■■■ 80.7
PUM2Q8TB72 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 80.7
PUM2Q8TB72 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.346e-27■■■■■ 80.6
PUM2Q8TB72 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.064e-9■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.014e-9■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.394e-9■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 ATMIN-202ENST00000539819 2434 ntTSL 26.08□□□□□ -1.444e-9■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 STARD8-205ENST00000523864 4864 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.41e-10■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.068e-7■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.318e-7■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.338e-7■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.422e-24■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 CIC-209ENST00000576505 1304 ntTSL 316.22■□□□□ 0.192e-24■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-24■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 80.5
PUM2Q8TB72 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.184e-8■■■■■ 80.4
PUM2Q8TB72 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.824e-8■■■■■ 80.4
PUM2Q8TB72 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.288e-7■■■■■ 80.4
PUM2Q8TB72 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.228e-7■■■■■ 80.4
PUM2Q8TB72 KAT8-207ENST00000573144 610 ntTSL 216.68■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 80.4
PUM2Q8TB72 KAT8-203ENST00000537402 1345 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 80.4
PUM2Q8TB72 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 80.4
PUM2Q8TB72 KAT8-204ENST00000538768 2500 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 80.4
PUM2Q8TB72 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 80.1
PUM2Q8TB72 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 79.8
PUM2Q8TB72 MFN1-202ENST00000357390 3148 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 79.8
PUM2Q8TB72 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 79.8
PUM2Q8TB72 SH3BGRL-203ENST00000474113 739 ntTSL 39.95□□□□□ -0.823e-11■■■■■ 79.7
PUM2Q8TB72 SH3BGRL-202ENST00000463546 755 ntTSL 29.95□□□□□ -0.823e-11■■■■■ 79.7
PUM2Q8TB72 RMND5B-204ENST00000507575 2092 ntTSL 217.35■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 79.4
PUM2Q8TB72 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 79.4
PUM2Q8TB72 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 79.4
PUM2Q8TB72 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 79.4
PUM2Q8TB72 RMND5B-209ENST00000513162 4250 ntTSL 210.67□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 79.4
PUM2Q8TB72 RMND5B-211ENST00000515360 2820 ntTSL 210.19□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 79.4
PUM2Q8TB72 MAP7D1-202ENST00000373148 1797 ntTSL 225.95■■□□□ 1.741e-8■■■■■ 79.2
PUM2Q8TB72 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 79.2
PUM2Q8TB72 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 79.2
PUM2Q8TB72 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 79.2
PUM2Q8TB72 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)10.62□□□□□ -0.712e-50■■■■■ 79
PUM2Q8TB72 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.594e-9■■■■■ 79
PUM2Q8TB72 MFSD1-215ENST00000484166 2121 ntTSL 217.16■□□□□ 0.344e-9■■■■■ 79
PUM2Q8TB72 MFSD1-213ENST00000480292 2239 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 79
PUM2Q8TB72 MFSD1-209ENST00000471500 2097 ntTSL 216.2■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 79
PUM2Q8TB72 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 79
PUM2Q8TB72 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 79
PUM2Q8TB72 MFSD1-204ENST00000465235 2042 ntTSL 25.47□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 79
PUM2Q8TB72 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 78.9
PUM2Q8TB72 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-11■■■■■ 78.7
PUM2Q8TB72 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-17■■■■■ 78.6
PUM2Q8TB72 NFKBIA-204ENST00000555371 690 ntTSL 39.61□□□□□ -0.879e-26■■■■■ 78.5
PUM2Q8TB72 SDAD1-204ENST00000502543 650 ntTSL 421.29■■□□□ 18e-7■■■■■ 78.4
PUM2Q8TB72 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.458e-7■■■■■ 78.4
PUM2Q8TB72 SDAD1-202ENST00000395710 3080 ntTSL 1 (best)4.44□□□□□ -1.78e-7■■■■■ 78.4
PUM2Q8TB72 IQSEC2-214ENST00000639796 2351 ntTSL 312.73□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 77.3
PUM2Q8TB72 IQSEC2-215ENST00000640005 1323 ntTSL 410.61□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 77.3
PUM2Q8TB72 IQSEC2-206ENST00000638521 4501 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.33□□□□□ -0.764e-8■■■■■ 77.3
PUM2Q8TB72 IQSEC2-209ENST00000638869 3000 ntTSL 59.72□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 77.3
PUM2Q8TB72 SKA2-209ENST00000583976 570 ntTSL 214.33□□□□□ -0.123e-19■■■■■ 77.2
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