Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Stn1Q8K2X3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stn1Q8K2X3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stn1Q8K2X3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stn1Q8K2X3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stn1Q8K2X3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stn1Q8K2X3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stn1Q8K2X3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stn1Q8K2X3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stn1Q8K2X3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stn1Q8K2X3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stn1Q8K2X3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stn1Q8K2X3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stn1Q8K2X3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stn1Q8K2X3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stn1Q8K2X3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Stn1Q8K2X3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stn1Q8K2X3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Stn1Q8K2X3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stn1Q8K2X3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Stn1Q8K2X3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stn1Q8K2X3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms