Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam53cQ8BXQ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam53cQ8BXQ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam53cQ8BXQ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam53cQ8BXQ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam53cQ8BXQ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam53cQ8BXQ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms