Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SprnQ8BWU1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SprnQ8BWU1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SprnQ8BWU1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SprnQ8BWU1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SprnQ8BWU1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SprnQ8BWU1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SprnQ8BWU1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms