Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI41

Synb, Syncytin-B, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynbQ8BI41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynbQ8BI41 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynbQ8BI41 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynbQ8BI41 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SynbQ8BI41 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynbQ8BI41 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynbQ8BI41 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynbQ8BI41 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynbQ8BI41 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynbQ8BI41 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynbQ8BI41 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynbQ8BI41 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynbQ8BI41 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SynbQ8BI41 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynbQ8BI41 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms