Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Actn1Q7TPR4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Actn1Q7TPR4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Actn1Q7TPR4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Actn1Q7TPR4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Actn1Q7TPR4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Actn1Q7TPR4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms