Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PREX2Q70Z35 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PREX2Q70Z35 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PREX2Q70Z35 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PREX2Q70Z35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PREX2Q70Z35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PREX2Q70Z35 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PREX2Q70Z35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PREX2Q70Z35 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PREX2Q70Z35 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
PREX2Q70Z35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PREX2Q70Z35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PREX2Q70Z35 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
PREX2Q70Z35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PREX2Q70Z35 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PREX2Q70Z35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PREX2Q70Z35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PREX2Q70Z35 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PREX2Q70Z35 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PREX2Q70Z35 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PREX2Q70Z35 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PREX2Q70Z35 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PREX2Q70Z35 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PREX2Q70Z35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PREX2Q70Z35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PREX2Q70Z35 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms