Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Soga3Q6NZL0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Soga3Q6NZL0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Soga3Q6NZL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Soga3Q6NZL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Soga3Q6NZL0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Soga3Q6NZL0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Soga3Q6NZL0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Soga3Q6NZL0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Soga3Q6NZL0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Soga3Q6NZL0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Soga3Q6NZL0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Soga3Q6NZL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Soga3Q6NZL0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Soga3Q6NZL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Soga3Q6NZL0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Soga3Q6NZL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Soga3Q6NZL0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Soga3Q6NZL0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Soga3Q6NZL0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Soga3Q6NZL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Soga3Q6NZL0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Soga3Q6NZL0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.6 ms