Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KdsrQ6GV12 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KdsrQ6GV12 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KdsrQ6GV12 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KdsrQ6GV12 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdsrQ6GV12 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms