Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf1Q64213 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf1Q64213 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf1Q64213 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf1Q64213 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf1Q64213 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf1Q64213 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf1Q64213 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf1Q64213 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf1Q64213 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf1Q64213 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf1Q64213 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf1Q64213 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms