Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PatjQ63ZW7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PatjQ63ZW7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PatjQ63ZW7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PatjQ63ZW7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PatjQ63ZW7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PatjQ63ZW7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PatjQ63ZW7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PatjQ63ZW7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PatjQ63ZW7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms