Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snta1Q61234 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snta1Q61234 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snta1Q61234 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snta1Q61234 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snta1Q61234 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snta1Q61234 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snta1Q61234 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snta1Q61234 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snta1Q61234 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snta1Q61234 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snta1Q61234 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms