Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P4ha2Q60716 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P4ha2Q60716 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P4ha2Q60716 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P4ha2Q60716 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P4ha2Q60716 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P4ha2Q60716 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P4ha2Q60716 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 746.5 ms