Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprnQ60673 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprnQ60673 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprnQ60673 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprnQ60673 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprnQ60673 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms