Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CARMIL1Q5VZK9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.63■■■■■ 4.58
CARMIL1Q5VZK9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CARMIL1Q5VZK9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CARMIL1Q5VZK9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CARMIL1Q5VZK9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CARMIL1Q5VZK9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CARMIL1Q5VZK9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CARMIL1Q5VZK9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CARMIL1Q5VZK9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
CARMIL1Q5VZK9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CARMIL1Q5VZK9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
CARMIL1Q5VZK9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CARMIL1Q5VZK9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms