Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mccc2Q3ULD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mccc2Q3ULD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mccc2Q3ULD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mccc2Q3ULD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms