Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim71Q1PSW8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim71Q1PSW8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim71Q1PSW8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim71Q1PSW8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim71Q1PSW8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim71Q1PSW8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms