Protein–RNA interactions for Protein: Q12365

BBP1, Spindle pole component BBP1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BBP1Q12365 LEU4YNL104C 1860 nt8.08□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 NPP2YEL016C 1482 nt8.07□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 MTG2YHR168W 1557 nt8.07□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 GLR1YPL091W 1452 nt8.06□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 NSG2YNL156C 900 nt8.06□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 PFS2YNL317W 1398 nt8.06□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 THI6YPL214C 1623 nt8.06□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 PMA2YPL036W 2844 nt8.05□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 HEM13YDR044W 987 nt8.04□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 AIM34YMR003W 597 nt8.04□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 HXT12YIL170W 1374 nt8.04□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 DLD2YDL178W 1593 nt8.04□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 TRP2YER090W 1524 nt8.03□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 HXT11YOL156W 1704 nt8.03□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 FRT1YOR324C 1809 nt8.03□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 SDH5YOL071W 489 nt8.03□□□□□ -1.12
BBP1Q12365 TSC10YBR265W 963 nt8.02□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 HSV2YGR223C 1347 nt8.02□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.01□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 YLR046CYLR046C 813 nt8.01□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 AKR2YOR034C 2250 nt8□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 AIM1YAL046C 357 nt8□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 ITR2YOL103W 1830 nt7.99□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 RTG2YGL252C 1767 nt7.99□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 SRM1YGL097W 1449 nt7.98□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 KRR1YCL059C 951 nt7.98□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 YLR111WYLR111W 333 nt7.98□□□□□ -1.13
BBP1Q12365 YMR103CYMR103C 363 nt7.96□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 YMR244WYMR244W 1068 nt7.96□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 VMA11YPL234C 495 nt7.96□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 ITR1YDR497C 1755 nt7.96□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 GGC1YDL198C 903 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 YMR226CYMR226C 804 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 RSC4YKR008W 1878 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 ECM10YEL030W 1935 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 TOP3YLR234W 1971 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 FTH1YBR207W 1398 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.95□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 GCD11YER025W 1584 nt7.94□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 RAD23YEL037C 1197 nt7.94□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 YGR012WYGR012W 1182 nt7.94□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 CHA1YCL064C 1083 nt7.93□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 YLR173WYLR173W 1827 nt7.93□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 NDE1YMR145C 1683 nt7.92□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 SLM3YDL033C 1254 nt7.91□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 APT2YDR441C 546 nt7.91□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 ENT4YLL038C 744 nt7.91□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 YLR279WYLR279W 390 nt7.91□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 MDH2YOL126C 1134 nt7.91□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 SNX3YOR357C 489 nt7.91□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 TIP1YBR067C 633 nt7.91□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 PRC1YMR297W 1599 nt7.91□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 CTF3YLR381W 2202 nt7.9□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 SEC61YLR378C 1443 nt7.9□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 OXA1YER154W 1209 nt7.9□□□□□ -1.14
BBP1Q12365 DIA4YHR011W 1341 nt7.89□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 AFG2YLR397C 2343 nt7.88□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 YDR467CYDR467C 327 nt7.87□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 EMC3YKL207W 762 nt7.87□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 BEM1YBR200W 1656 nt7.86□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 RBG2YGR173W 1107 nt7.86□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 MSB4YOL112W 1479 nt7.86□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 TAT2YOL020W 1779 nt7.85□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.85□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 ATP10YLR393W 840 nt7.84□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 PMT7YDR307W 1989 nt7.84□□□□□ -1.15
BBP1Q12365 RIB3YDR487C 627 nt7.83□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 YMR210WYMR210W 1350 nt7.83□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 FCY21YER060W 1587 nt7.8□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 YIL108WYIL108W 2091 nt7.8□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 YER188WYER188W 720 nt7.8□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 SPE4YLR146C 903 nt7.8□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 OSH7YHR001W 1314 nt7.79□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 YLR072WYLR072W 2082 nt7.79□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 FUB1YCR076C 753 nt7.79□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 ERG6YML008C 1152 nt7.78□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 ATO2YNR002C 849 nt7.78□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 AAT1YKL106W 1356 nt7.78□□□□□ -1.16
BBP1Q12365 CCR4YAL021C 2514 nt7.77□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 GND1YHR183W 1470 nt7.77□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.77□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 YMR253CYMR253C 1245 nt7.77□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 ERR3YMR323W 1314 nt7.76□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 ERR1YOR393W 1314 nt7.76□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 ERR2YPL281C 1314 nt7.76□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 MSC1YML128C 1542 nt7.74□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.74□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.74□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.74□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.74□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 YPL264CYPL264C 1062 nt7.74□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 YBL095WYBL095W 813 nt7.73□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 BNI5YNL166C 1347 nt7.73□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 MAS2YHR024C 1449 nt7.72□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 LOT5YKL183W 921 nt7.72□□□□□ -1.17
BBP1Q12365 CAB5YDR196C 726 nt7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.8 ms