RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q12270
RBD2, Rhomboid protein 2, yeast
Predictions only
Length
262 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RBD2
Q12270
DPL1
YDR294C
1770 nt
8.17
□□□□□ -1.1
RBD2
Q12270
KRR1
YCL059C
951 nt
8.17
□□□□□ -1.1
RBD2
Q12270
TIP1
YBR067C
633 nt
8.17
□□□□□ -1.1
RBD2
Q12270
EAF3
YPR023C
1206 nt
8.17
□□□□□ -1.1
RBD2
Q12270
LSB5
YCL034W
1065 nt
8.16
□□□□□ -1.1
RBD2
Q12270
OYE2
YHR179W
1203 nt
8.15
□□□□□ -1.1
RBD2
Q12270
SNX3
YOR357C
489 nt
8.15
□□□□□ -1.1
RBD2
Q12270
YPL222C-A
YPL222C-A
246 nt
8.14
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
RPT5
YOR117W
1305 nt
8.13
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
INH1
YDL181W
258 nt
8.13
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
NSG2
YNL156C
900 nt
8.13
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
SAC7
YDR389W
1965 nt
8.13
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
ERG13
YML126C
1476 nt
8.13
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
LEU4
YNL104C
1860 nt
8.12
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
LSM5
YER146W
282 nt
8.11
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
SMM1
YNR015W
1155 nt
8.11
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
GND1
YHR183W
1470 nt
8.1
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
PUS7
YOR243C
2031 nt
8.09
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
MEX67
YPL169C
1800 nt
8.09
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
RAD23
YEL037C
1197 nt
8.09
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
YJL118W
YJL118W
660 nt
8.09
□□□□□ -1.11
RBD2
Q12270
YLR173W
YLR173W
1827 nt
8.08
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
TPS1
YBR126C
1488 nt
8.08
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
FET5
YFL041W
1869 nt
8.08
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
DDI1
YER143W
1287 nt
8.07
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)B
tD(GUC)B
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)D
tD(GUC)D
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)G1
tD(GUC)G1
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)G2
tD(GUC)G2
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)I1
tD(GUC)I1
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)I2
tD(GUC)I2
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)J1
tD(GUC)J1
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)J2
tD(GUC)J2
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)J3
tD(GUC)J3
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)J4
tD(GUC)J4
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)K
tD(GUC)K
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)L1
tD(GUC)L1
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)L2
tD(GUC)L2
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)M
tD(GUC)M
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tD(GUC)O
tD(GUC)O
72 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
YMR265C
YMR265C
1386 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
NPP2
YEL016C
1482 nt
8.05
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
RRT8
YOL048C
1029 nt
8.04
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tE(CUC)D
tE(CUC)D
72 nt
8.03
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
tE(CUC)I
tE(CUC)I
72 nt
8.03
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
LOT5
YKL183W
921 nt
8.03
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
TMA23
YMR269W
636 nt
8.03
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
MIM1
YOL026C
342 nt
8.03
□□□□□ -1.12
RBD2
Q12270
CAB5
YDR196C
726 nt
8.02
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
RIB3
YDR487C
627 nt
8.02
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
ELO1
YJL196C
933 nt
8.02
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
YDR467C
YDR467C
327 nt
8.01
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
HBS1
YKR084C
1836 nt
8.01
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
YJL055W
YJL055W
738 nt
8
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
YNR064C
YNR064C
873 nt
8
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
HAP5
YOR358W
729 nt
8
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
SUV3
YPL029W
2214 nt
7.99
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
IMO32
YGR031W
1029 nt
7.99
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
MDL2
YPL270W
2322 nt
7.99
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
HXT12
YIL170W
1374 nt
7.98
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
RPN14
YGL004C
1254 nt
7.98
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
VRG4
YGL225W
1014 nt
7.97
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
RIB7
YBR153W
735 nt
7.97
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
GAL3
YDR009W
1563 nt
7.97
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
LSB3
YFR024C-A
1380 nt
7.97
□□□□□ -1.13
RBD2
Q12270
KEL3
YPL263C
1956 nt
7.95
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
TOM71
YHR117W
1920 nt
7.95
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
SNU66
YOR308C
1764 nt
7.94
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
TRP2
YER090W
1524 nt
7.94
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
DUR3
YHL016C
2208 nt
7.94
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
ADE8
YDR408C
645 nt
7.94
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
YJR114W
YJR114W
393 nt
7.94
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
YLR111W
YLR111W
333 nt
7.94
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
MTO1
YGL236C
2010 nt
7.94
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
HXT11
YOL156W
1704 nt
7.93
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
THI6
YPL214C
1623 nt
7.92
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
DAK2
YFL053W
1776 nt
7.92
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
OPI3
YJR073C
621 nt
7.91
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
YLR437C-A
YLR437C-A
228 nt
7.91
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
YBL095W
YBL095W
813 nt
7.91
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
SFL1
YOR140W
2301 nt
7.9
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
RTG2
YGL252C
1767 nt
7.9
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
GPM1
YKL152C
744 nt
7.9
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
CRC1
YOR100C
984 nt
7.9
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
ORT1
YOR130C
879 nt
7.9
□□□□□ -1.14
RBD2
Q12270
ADE2
YOR128C
1716 nt
7.89
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
TPN1
YGL186C
1740 nt
7.88
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
YFL015W-A
YFL015W-A
318 nt
7.87
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
snR31
snR31
225 nt
7.87
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
SRM1
YGL097W
1449 nt
7.86
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
AAT1
YKL106W
1356 nt
7.86
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
YFR036W-A
YFR036W-A
651 nt
7.86
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
EMC3
YKL207W
762 nt
7.86
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
FIT1
YDR534C
1587 nt
7.85
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
SWT21
YNL187W
1074 nt
7.85
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
MET1
YKR069W
1782 nt
7.84
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
RIB2
YOL066C
1776 nt
7.84
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
YMR244W
YMR244W
1068 nt
7.84
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
snR4
snR4
186 nt
7.84
□□□□□ -1.15
RBD2
Q12270
DUS3
YLR401C
2007 nt
7.84
□□□□□ -1.15
First
Previous
6
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 108 ms