Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 ARO8YGL202W 1503 nt8.75□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 YDR455CYDR455C 309 nt8.75□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 MHF1YOL086W-A 273 nt8.75□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 PUS7YOR243C 2031 nt8.75□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 STP3YLR375W 1032 nt8.74□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 YBR232CYBR232C 360 nt8.74□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 TOK1YJL093C 2076 nt8.73□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 IMO32YGR031W 1029 nt8.73□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 POT1YIL160C 1254 nt8.73□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 IML3YBR107C 738 nt8.73□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 CCT2YIL142W 1584 nt8.73□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 SEN2YLR105C 1134 nt8.72□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 Q0010Q0010 387 nt8.71□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 KES1YPL145C 1305 nt8.71□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 PSD1YNL169C 1503 nt8.7□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 SGA1YIL099W 1650 nt8.7□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 YDL086WYDL086W 822 nt8.7□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.7□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.7□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.7□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.7□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 CYT1YOR065W 930 nt8.69□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 BET2YPR176C 978 nt8.69□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.67□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 YHL008CYHL008C 1884 nt8.67□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 GSF2YML048W 1212 nt8.67□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 ERG13YML126C 1476 nt8.66□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 APS2YJR058C 444 nt8.66□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 RRT8YOL048C 1029 nt8.66□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 TUB4YLR212C 1422 nt8.65□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 SPS100YHR139C 981 nt8.65□□□□□ -1.02
SMF3Q12078 NIF3YGL221C 867 nt8.64□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 NAP1YKR048C 1254 nt8.64□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 FRA1YLL029W 2250 nt8.63□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 ADE8YDR408C 645 nt8.63□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 YJL064WYJL064W 396 nt8.63□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 AIM1YAL046C 357 nt8.63□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 DMA2YNL116W 1569 nt8.62□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 PUP1YOR157C 786 nt8.62□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 LSB6YJL100W 1824 nt8.61□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 PAR32YDL173W 888 nt8.61□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 TPO4YOR273C 1980 nt8.61□□□□□ -1.03
SMF3Q12078 HMG2YLR450W 3138 nt8.58□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 ZAP1YJL056C 2643 nt8.58□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 YJR114WYJR114W 393 nt8.58□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 PAU19YMR325W 375 nt8.58□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 TVP23YDR084C 600 nt8.57□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 SAC7YDR389W 1965 nt8.56□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 OPI3YJR073C 621 nt8.56□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 ABZ2YMR289W 1125 nt8.55□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 QDR2YIL121W 1629 nt8.54□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 ENT4YLL038C 744 nt8.54□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 DIG1YPL049C 1359 nt8.53□□□□□ -1.04
SMF3Q12078 YLR046CYLR046C 813 nt8.52□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 ODC1YPL134C 933 nt8.52□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 NAS2YIL007C 663 nt8.51□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 IGD1YFR017C 588 nt8.5□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 KRE1YNL322C 942 nt8.5□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 HXK1YFR053C 1458 nt8.5□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 YHR218WYHR218W 1812 nt8.5□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 CDD1YLR245C 429 nt8.49□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 YNR064CYNR064C 873 nt8.48□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 GID8YMR135C 1368 nt8.48□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 URA8YJR103W 1737 nt8.47□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 SLG1YOR008C 1137 nt8.47□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 TIP1YBR067C 633 nt8.47□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 ENO2YHR174W 1314 nt8.47□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 ALD5YER073W 1563 nt8.47□□□□□ -1.05
SMF3Q12078 SPE2YOL052C 1191 nt8.46□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 ITR2YOL103W 1830 nt8.45□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 AMF1YOR378W 1548 nt8.44□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 TPC1YGR096W 945 nt8.44□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 ELO1YJL196C 933 nt8.44□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 THP3YPR045C 1413 nt8.44□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 DLD3YEL071W 1491 nt8.44□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 SSL2YIL143C 2532 nt8.43□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 PCP1YGR101W 1041 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 YKL133CYKL133C 1392 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 MRS6YOR370C 1812 nt8.42□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 YJR154WYJR154W 1041 nt8.41□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 TIM44YIL022W 1296 nt8.4□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 IPL1YPL209C 1104 nt8.4□□□□□ -1.06
SMF3Q12078 KEL3YPL263C 1956 nt8.39□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 YHR219WYHR219W 1875 nt8.39□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 MDM35YKL053C-A 261 nt8.39□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 YOR072WYOR072W 315 nt8.39□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 SFL1YOR140W 2301 nt8.38□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 HXT10YFL011W 1641 nt8.37□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 PHB2YGR231C 933 nt8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.4 ms