Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 ADE8YDR408C 645 nt9.18□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 LSB6YJL100W 1824 nt9.18□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 ACO2YJL200C 2370 nt9.17□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 NIF3YGL221C 867 nt9.17□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 GSF2YML048W 1212 nt9.17□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 TUB4YLR212C 1422 nt9.16□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 BET2YPR176C 978 nt9.16□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 HOL1YNR055C 1761 nt9.14□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 SAC7YDR389W 1965 nt9.13□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 YJR114WYJR114W 393 nt9.12□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 ARO8YGL202W 1503 nt9.11□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 TVP23YDR084C 600 nt9.11□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 YJL064WYJL064W 396 nt9.11□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 OPI3YJR073C 621 nt9.11□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 NPP1YCR026C 2229 nt9.1□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 QDR2YIL121W 1629 nt9.09□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 NAP1YKR048C 1254 nt9.09□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 DIG1YPL049C 1359 nt9.09□□□□□ -0.95
VPS54Q12071 TPO4YOR273C 1980 nt9.08□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 HMG2YLR450W 3138 nt9.08□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 PAR32YDL173W 888 nt9.08□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 ENT4YLL038C 744 nt9.08□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 YLR046CYLR046C 813 nt9.08□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 ABZ2YMR289W 1125 nt9.08□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 PUP1YOR157C 786 nt9.08□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 ESBP6YNL125C 2022 nt9.06□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 PAU19YMR325W 375 nt9.05□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 COQ8YGL119W 1506 nt9.05□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 NAS2YIL007C 663 nt9.04□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 KES1YPL145C 1305 nt9.04□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 CDD1YLR245C 429 nt9.03□□□□□ -0.96
VPS54Q12071 YNR064CYNR064C 873 nt9.02□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 ITR2YOL103W 1830 nt9.02□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 GID8YMR135C 1368 nt9.01□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 IGD1YFR017C 588 nt9.01□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 DLD3YEL071W 1491 nt9.01□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 ELO1YJL196C 933 nt9□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 KRE1YNL322C 942 nt9□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 ENO2YHR174W 1314 nt9□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 YMR209CYMR209C 1374 nt8.99□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 SGA1YIL099W 1650 nt8.98□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 SPE2YOL052C 1191 nt8.98□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 YHR219WYHR219W 1875 nt8.98□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 AMF1YOR378W 1548 nt8.97□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 MRS6YOR370C 1812 nt8.97□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 TPC1YGR096W 945 nt8.97□□□□□ -0.97
VPS54Q12071 ZAP1YJL056C 2643 nt8.95□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 PCP1YGR101W 1041 nt8.95□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 TIP1YBR067C 633 nt8.95□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 YKL133CYKL133C 1392 nt8.95□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 HIS2YFR025C 1008 nt8.94□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 LSR1LSR1 1175 nt8.94□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 SLG1YOR008C 1137 nt8.94□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 SFL1YOR140W 2301 nt8.94□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 THP3YPR045C 1413 nt8.94□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 UGP1YKL035W 1500 nt8.94□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 YHL008CYHL008C 1884 nt8.93□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 KEL3YPL263C 1956 nt8.93□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.92□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 SUV3YPL029W 2214 nt8.91□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 SWT21YNL187W 1074 nt8.91□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 IPL1YPL209C 1104 nt8.9□□□□□ -0.98
VPS54Q12071 DTR1YBR180W 1719 nt8.89□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 PHB2YGR231C 933 nt8.89□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 ADH3YMR083W 1128 nt8.89□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 MET1YKR069W 1782 nt8.89□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 VMA11YPL234C 495 nt8.88□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 LEU2YCL018W 1095 nt8.88□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 URA8YJR103W 1737 nt8.88□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 NAM8YHR086W 1572 nt8.87□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 YMR265CYMR265C 1386 nt8.86□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 FSH2YMR222C 672 nt8.86□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 FLX1YIL134W 936 nt8.85□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 YKL053WYKL053W 375 nt8.85□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 HAP5YOR358W 729 nt8.85□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 ILV2YMR108W 2064 nt8.85□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 PSD1YNL169C 1503 nt8.85□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 HEM14YER014W 1620 nt8.84□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 YCR025CYCR025C 411 nt8.84□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 YKR012CYKR012C 378 nt8.84□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 CRC1YOR100C 984 nt8.84□□□□□ -0.99
VPS54Q12071 TIM44YIL022W 1296 nt8.83□□□□□ -1
VPS54Q12071 MOB1YIL106W 945 nt8.83□□□□□ -1
VPS54Q12071 SNX3YOR357C 489 nt8.83□□□□□ -1
VPS54Q12071 RPD3YNL330C 1302 nt8.82□□□□□ -1
VPS54Q12071 snR31snR31 225 nt8.81□□□□□ -1
VPS54Q12071 HXK1YFR053C 1458 nt8.81□□□□□ -1
VPS54Q12071 SSL2YIL143C 2532 nt8.8□□□□□ -1
VPS54Q12071 CYT1YOR065W 930 nt8.8□□□□□ -1
VPS54Q12071 RPN14YGL004C 1254 nt8.79□□□□□ -1
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