Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms