Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkpd1Q0VF94 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkpd1Q0VF94 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkpd1Q0VF94 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nkpd1Q0VF94 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nkpd1Q0VF94 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkpd1Q0VF94 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms