Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nrp1P97333 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nrp1P97333 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrp1P97333 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nrp1P97333 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nrp1P97333 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nrp1P97333 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nrp1P97333 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrp1P97333 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrp1P97333 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Nrp1P97333 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nrp1P97333 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nrp1P97333 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrp1P97333 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nrp1P97333 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms