Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPEP62304 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPEP62304 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPEP62304 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNRPEP62304 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms