Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms