Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc5P35689 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc5P35689 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc5P35689 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc5P35689 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc5P35689 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc5P35689 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc5P35689 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms