Protein–RNA interactions for Protein: P32380

SPC110, Spindle pole body component 110, yeastyeast

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC110P32380 CAB5YDR196C 726 nt9.8□□□□□ -0.84
SPC110P32380 UFD1YGR048W 1086 nt9.8□□□□□ -0.84
SPC110P32380 OYE2YHR179W 1203 nt9.79□□□□□ -0.84
SPC110P32380 MDM35YKL053C-A 261 nt9.79□□□□□ -0.84
SPC110P32380 LSR1LSR1 1175 nt9.79□□□□□ -0.84
SPC110P32380 DLD3YEL071W 1491 nt9.79□□□□□ -0.84
SPC110P32380 LSM5YER146W 282 nt9.78□□□□□ -0.84
SPC110P32380 TIP1YBR067C 633 nt9.77□□□□□ -0.85
SPC110P32380 EAF3YPR023C 1206 nt9.77□□□□□ -0.85
SPC110P32380 SFL1YOR140W 2301 nt9.77□□□□□ -0.85
SPC110P32380 CWP2YKL096W-A 279 nt9.76□□□□□ -0.85
SPC110P32380 LOT5YKL183W 921 nt9.76□□□□□ -0.85
SPC110P32380 DAK2YFL053W 1776 nt9.73□□□□□ -0.85
SPC110P32380 TPS1YBR126C 1488 nt9.72□□□□□ -0.85
SPC110P32380 YDR455CYDR455C 309 nt9.72□□□□□ -0.85
SPC110P32380 YJL118WYJL118W 660 nt9.72□□□□□ -0.85
SPC110P32380 SAM3YPL274W 1764 nt9.72□□□□□ -0.85
SPC110P32380 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.72□□□□□ -0.85
SPC110P32380 VRG4YGL225W 1014 nt9.71□□□□□ -0.86
SPC110P32380 VMA11YPL234C 495 nt9.71□□□□□ -0.86
SPC110P32380 HXT10YFL011W 1641 nt9.71□□□□□ -0.86
SPC110P32380 ITR2YOL103W 1830 nt9.7□□□□□ -0.86
SPC110P32380 YJL055WYJL055W 738 nt9.69□□□□□ -0.86
SPC110P32380 ERG13YML126C 1476 nt9.69□□□□□ -0.86
SPC110P32380 FIT1YDR534C 1587 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC110P32380 DDI1YER143W 1287 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC110P32380 YMR262WYMR262W 942 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC110P32380 RIB7YBR153W 735 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC110P32380 YPI1YFR003C 468 nt9.66□□□□□ -0.86
SPC110P32380 YRF1-2YER190W 5046 nt9.65□□□□□ -0.86
SPC110P32380 NSG2YNL156C 900 nt9.64□□□□□ -0.87
SPC110P32380 SNX3YOR357C 489 nt9.64□□□□□ -0.87
SPC110P32380 KRR1YCL059C 951 nt9.63□□□□□ -0.87
SPC110P32380 RPC31YNL151C 756 nt9.62□□□□□ -0.87
SPC110P32380 HXT12YIL170W 1374 nt9.62□□□□□ -0.87
SPC110P32380 TMA23YMR269W 636 nt9.61□□□□□ -0.87
SPC110P32380 NBA1YOL070C 1506 nt9.61□□□□□ -0.87
SPC110P32380 THI6YPL214C 1623 nt9.6□□□□□ -0.87
SPC110P32380 INH1YDL181W 258 nt9.59□□□□□ -0.87
SPC110P32380 RIM2YBR192W 1134 nt9.59□□□□□ -0.87
SPC110P32380 AGP3YFL055W 1677 nt9.58□□□□□ -0.88
SPC110P32380 RRT8YOL048C 1029 nt9.57□□□□□ -0.88
SPC110P32380 ADH1YOL086C 1047 nt9.57□□□□□ -0.88
SPC110P32380 SAC7YDR389W 1965 nt9.57□□□□□ -0.88
SPC110P32380 GAL3YDR009W 1563 nt9.56□□□□□ -0.88
SPC110P32380 IMO32YGR031W 1029 nt9.56□□□□□ -0.88
SPC110P32380 ELO1YJL196C 933 nt9.56□□□□□ -0.88
SPC110P32380 RIB2YOL066C 1776 nt9.55□□□□□ -0.88
SPC110P32380 YNR029CYNR029C 1290 nt9.55□□□□□ -0.88
SPC110P32380 ADE8YDR408C 645 nt9.54□□□□□ -0.88
SPC110P32380 MET30YIL046W 1923 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC110P32380 RPN14YGL004C 1254 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC110P32380 YJR114WYJR114W 393 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC110P32380 YNR064CYNR064C 873 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC110P32380 MIM1YOL026C 342 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC110P32380 RTG2YGL252C 1767 nt9.52□□□□□ -0.88
SPC110P32380 DUR3YHL016C 2208 nt9.52□□□□□ -0.88
SPC110P32380 YMR265CYMR265C 1386 nt9.52□□□□□ -0.88
SPC110P32380 DPL1YDR294C 1770 nt9.51□□□□□ -0.89
SPC110P32380 YJL195CYJL195C 702 nt9.51□□□□□ -0.89
SPC110P32380 LEU4YNL104C 1860 nt9.51□□□□□ -0.89
SPC110P32380 YLR173WYLR173W 1827 nt9.49□□□□□ -0.89
SPC110P32380 HAP5YOR358W 729 nt9.49□□□□□ -0.89
SPC110P32380 FUN14YAL008W 597 nt9.48□□□□□ -0.89
SPC110P32380 YNL190WYNL190W 615 nt9.48□□□□□ -0.89
SPC110P32380 KEL3YPL263C 1956 nt9.48□□□□□ -0.89
SPC110P32380 RSC4YKR008W 1878 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 YDR467CYDR467C 327 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC110P32380 GCD11YER025W 1584 nt9.46□□□□□ -0.9
SPC110P32380 snR31snR31 225 nt9.44□□□□□ -0.9
SPC110P32380 DUS3YLR401C 2007 nt9.43□□□□□ -0.9
SPC110P32380 LAS17YOR181W 1902 nt9.43□□□□□ -0.9
SPC110P32380 OPI3YJR073C 621 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC110P32380 ECM10YEL030W 1935 nt9.41□□□□□ -0.9
SPC110P32380 HBS1YKR084C 1836 nt9.41□□□□□ -0.9
SPC110P32380 SUV3YPL029W 2214 nt9.41□□□□□ -0.9
SPC110P32380 ADE5,7YGL234W 2409 nt9.41□□□□□ -0.9
SPC110P32380 NPP2YEL016C 1482 nt9.4□□□□□ -0.9
SPC110P32380 YEL008WYEL008W 381 nt9.39□□□□□ -0.91
SPC110P32380 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.39□□□□□ -0.91
SPC110P32380 TVP23YDR084C 600 nt9.38□□□□□ -0.91
SPC110P32380 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.38□□□□□ -0.91
SPC110P32380 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.38□□□□□ -0.91
SPC110P32380 STE4YOR212W 1272 nt9.38□□□□□ -0.91
SPC110P32380 CRC1YOR100C 984 nt9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms