Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc11P31313 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc11P31313 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc11P31313 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc11P31313 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc11P31313 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc11P31313 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms