Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxrgP28705 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RxrgP28705 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RxrgP28705 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RxrgP28705 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RxrgP28705 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RxrgP28705 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RxrgP28705 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RxrgP28705 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RxrgP28705 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RxrgP28705 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RxrgP28705 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RxrgP28705 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxrgP28705 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RxrgP28705 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RxrgP28705 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RxrgP28705 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms