Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nfkb1P25799 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nfkb1P25799 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nfkb1P25799 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nfkb1P25799 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfkb1P25799 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfkb1P25799 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms