Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGB4P16144 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGB4P16144 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ITGB4P16144 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGB4P16144 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGB4P16144 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGB4P16144 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ITGB4P16144 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ITGB4P16144 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITGB4P16144 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITGB4P16144 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITGB4P16144 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ITGB4P16144 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ITGB4P16144 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGB4P16144 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGB4P16144 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms