Protein–RNA interactions for Protein: P15089

Cpa3, Mast cell carboxypeptidase A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa3P15089 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa3P15089 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa3P15089 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpa3P15089 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpa3P15089 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa3P15089 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa3P15089 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms