Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00271P0C7V0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00271P0C7V0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC00271P0C7V0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LINC00271P0C7V0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LINC00271P0C7V0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00271P0C7V0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00271P0C7V0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00271P0C7V0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00271P0C7V0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00271P0C7V0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00271P0C7V0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00271P0C7V0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00271P0C7V0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00271P0C7V0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00271P0C7V0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LINC00271P0C7V0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LINC00271P0C7V0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00271P0C7V0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00271P0C7V0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00271P0C7V0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00271P0C7V0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00271P0C7V0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00271P0C7V0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms