Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Hoxa7P02830 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hoxa7P02830 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hoxa7P02830 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxa7P02830 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Hoxa7P02830 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hoxa7P02830 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hoxa7P02830 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hoxa7P02830 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hoxa7P02830 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa7P02830 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxa7P02830 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxa7P02830 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxa7P02830 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxa7P02830 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxa7P02830 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxa7P02830 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxa7P02830 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxa7P02830 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxa7P02830 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxa7P02830 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxa7P02830 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms