Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnnal1O88327 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnnal1O88327 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ctnnal1O88327 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctnnal1O88327 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnnal1O88327 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnnal1O88327 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctnnal1O88327 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnnal1O88327 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnnal1O88327 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnnal1O88327 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnnal1O88327 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnnal1O88327 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnnal1O88327 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ctnnal1O88327 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnnal1O88327 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnal1O88327 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnal1O88327 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1234.7 ms