Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnajb6O54946 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnajb6O54946 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajb6O54946 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1668.4 ms