Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnajb6O54946 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnajb6O54946 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajb6O54946 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnajb6O54946 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnajb6O54946 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnajb6O54946 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnajb6O54946 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dnajb6O54946 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnajb6O54946 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajb6O54946 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms