Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,37■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Cited2O35740 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Cited2O35740 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19,35■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19,35■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19,35■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Cited2O35740 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19,33■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,33■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19,3■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19,3■□□□□ 0,68
Cited2O35740 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19,3■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,29■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19,27■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19,27■□□□□ 0,68
Cited2O35740 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19,26■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19,25■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19,23■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,21■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19,21■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Cited2O35740 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19,17■□□□□ 0,66
Cited2O35740 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19,17■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Cited2O35740 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19,16■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19,16■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Cited2O35740 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,14■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,14■□□□□ 0,65
Cited2O35740 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Cited2O35740 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Cited2O35740 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19,11■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19,09■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Cited2O35740 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Cited2O35740 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19,08■□□□□ 0,65
Cited2O35740 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19,08■□□□□ 0,64
Cited2O35740 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Cited2O35740 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19,08■□□□□ 0,64
Cited2O35740 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Cited2O35740 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Cited2O35740 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Cited2O35740 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19,07■□□□□ 0,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,7 ms