Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited2O35740 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited2O35740 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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Cited2O35740 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Cited2O35740 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Cited2O35740 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited2O35740 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Cited2O35740 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Cited2O35740 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cited2O35740 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited2O35740 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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Cited2O35740 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cited2O35740 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Cited2O35740 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Cited2O35740 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited2O35740 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited2O35740 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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