Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SYNMO15061 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SYNMO15061 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SYNMO15061 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SYNMO15061 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SYNMO15061 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SYNMO15061 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNMO15061 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SYNMO15061 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SYNMO15061 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SYNMO15061 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SYNMO15061 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SYNMO15061 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SYNMO15061 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SYNMO15061 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNMO15061 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNMO15061 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNMO15061 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SYNMO15061 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SYNMO15061 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SYNMO15061 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SYNMO15061 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNMO15061 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNMO15061 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNMO15061 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNMO15061 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SYNMO15061 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SYNMO15061 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SYNMO15061 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SYNMO15061 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SYNMO15061 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SYNMO15061 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SYNMO15061 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SYNMO15061 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SYNMO15061 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SYNMO15061 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SYNMO15061 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SYNMO15061 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SYNMO15061 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SYNMO15061 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SYNMO15061 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SYNMO15061 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SYNMO15061 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SYNMO15061 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SYNMO15061 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SYNMO15061 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SYNMO15061 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SYNMO15061 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SYNMO15061 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SYNMO15061 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SYNMO15061 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SYNMO15061 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SYNMO15061 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SYNMO15061 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SYNMO15061 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SYNMO15061 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SYNMO15061 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SYNMO15061 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SYNMO15061 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SYNMO15061 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SYNMO15061 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SYNMO15061 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYNMO15061 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYNMO15061 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYNMO15061 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNMO15061 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNMO15061 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNMO15061 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNMO15061 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNMO15061 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNMO15061 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNMO15061 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYNMO15061 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SYNMO15061 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
SYNMO15061 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SYNMO15061 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SYNMO15061 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYNMO15061 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYNMO15061 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYNMO15061 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SYNMO15061 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYNMO15061 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYNMO15061 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNMO15061 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNMO15061 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYNMO15061 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYNMO15061 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYNMO15061 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SYNMO15061 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SYNMO15061 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms