Protein–RNA interactions for Protein: O08747

Unc5c, Netrin receptor UNC5C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5cO08747 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Unc5cO08747 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Unc5cO08747 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Unc5cO08747 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Unc5cO08747 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Unc5cO08747 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Unc5cO08747 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms