Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem200cJ3QK46 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem200cJ3QK46 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmem200cJ3QK46 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem200cJ3QK46 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms